Profesor jornada completa
- christopher.cooper@usm.cl
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Christopher Cooper Villagrán
Doctor of Philosophy (Ph.D.) in Mechanical Engineering, Boston University, USA.
Ingeniero Civil Mecánico, Universidad Técnica Federico Santa María, Chile.
Áreas de especialización
Mecánica Computacional, Modelos Continuos en Biofísica, Métodos Integrales de Frontera, Algoritmos Rápidos.
Grupo de trabajo con estudiantes
Publicaciones Seleccionadas
- S. Search, C. D. Cooper, E. van’t Wout, Towards optimal boundary integral formulations of the Poisson–Boltzmann equation for molecular electrostatics, Journal of Computational Chemistry, 2022.
- V Ramm, J. Chaudhry, C.D. Cooper. Efficient mesh refinement for the Poisson‐Boltzmann equation with boundary elements, Journal of Computational Chemistry, 2021
- Martínez, C.D. Cooper, A. Poma, H.V. Guzmán. Free energies of the disassembly of viral capsids from a multiscale molecular simulation approach, Journal of Chemical Information and Modeling, 2019.
- C. Clementi, C.D. Cooper, L.A. Barba. Computational Nanoplasmonics in the Quasistatic Limit for Biosensing Applications, Physical Review E, 2019.
- D. Cooper, A Boundary‐Integral Approach for the Poisson–Boltzmann Equation with Polarizable Force Fields, Journal of Computational Chemistry, ISSN 1096-987X, 2019.
- Molavi Tabrizi, S. Goossens, A. Mehdizadeh Rahimi, C.D. Cooper, M.G. Knepley, J.P. Bardhan, Extending the Solvation-Layer Interface Condition Continum Electrostatic Model to a Linearized Poisson–Boltzmann Solvent, Journal of Chemical Theory and Computation, ISSN 1549-9618, 2017.
- D. Cooper, L.A. Barba, Poisson–Boltzmann model for protein–surface electrostatic interactions and grid-convergence study using the PyGBe code, ISSN 0010-4655, 2016.
- D. Cooper, N.C. Clementi, L.A. Barba, Poisson-Boltzmann model for protein-surface electrostatic interactions and grid-convergence study using the PyGBe code, Journal of Chemical Physics, ISSN 0021-9606, 2015.
- D. Cooper, J.P. Bardhan, L.A. Barba, Probing protein orientation near charged nanosurfaces for simulation-assisted biosensor design, Computer Physics Communications, ISSN 0010-4655, 2014.
Otras publicaciones
- D. Cooper, L.A. Barba, Panel-free boundary conditions for viscous vortex methods, 19th AIAA Computational Fluid Dynamics Conference, ISBN: 978-156347975-5, 2009.
- C Clementi, G. Forsyth, C.D. Cooper, L.A. Barba, PyGBe-LSPR: Python and GPU Boundary-integral solver for electrostatics, The Journal of Open Source Software, 2017.
- D. Cooper, N.C. Clementi, G. Forsyth, L.A. Barba, PyGBe: Python, GPUs and Boundary elements for biomolecular electrostatics, The Journal of Open Source Software, 2016.
Proyectos de investigación
- “Modelos moleculares multiescala para simulaciones rápidas de alta precisión de la disolución de biomoléculas”, Proyecto Interno USM, Investigador Responsable, 2020.
- “Preparación y caracterización de metamateriales magnéticos para detección remota de tensiones en neumáticos”, FONDEF IDeA en Dos Etapas ID16I10048, Co-investigador, año de adjudicación 2017, duración 2 años.
- “Full viruses on your local cluster: parallel simulations of virus-cell electrostatic interactions”, FONDECYT Iniciación 11160768, Investigador Principal, año de adjudicación 2016, duración 3 años.
- “Modelación y diseño de prototipo para medir tensiones en compósitos poliméricos”, Proyecto Interno DGIP-USM, Investigador Principal, año de adjudicación 2016, duración 1 año.
- “Dinámica del escurrimiento sobre una superficie porosa: aplicación a la predicción de aluviones”, Proyecto Interno DGIP-USM, Co-investigador, año de adjudicación 2016, duración 1 año.
- “Modelación numérica de moléculas ligando en biosensores”, Proyecto Interno DGIP-USM 25-15-32, Investigador Principal, año de adjudicación 2015, duración 1 año.
